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Como objetivo primordial, Shipstern implementa de manera práctica y activa la conservación sobre su área. Por lo tanto, las actividades de conservación estan focalizadas en el patrullaje. Los patrullajes se llevan a cabo durante el día por toda la Reserva. En áreas remotas se lleva a cabo en patrullajes de 2 a 3 dias, con pequeños campamentos permanentes que permiten pasar la noche.
Los primeros seis meses del año, actividades de guardia extra son llevadas a cabo en la Laguna Shipstern. Desde el Campamento Iguana, morada de un guardián y su familia, se llevan a cabo patrullajes varias veces al día alrededor de dos islotes de manglar que albergan grandes colonias de la Ciguena Americana (Mycteria americana).Esto ha ayudado, desde su regreso a la Reserva en 1992, al incremento en el número de parejas reproductoras en un promedio de 200.
El Administrador de la Estación de Campo y su grupo de colaboradores son la pieza clave en la aplicación de las medidas de conservación. Además de las actividades de patrullaje, los guardianes de Shipstern se encargan del cuidado de las Instalaciones, la guía de grupos escolares y la bienvenida a los visitantes, además de las visitas al campo.
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